在风力发电机组控制系统中，安全保护系统是确保风机安全的最高层的防护措施。机组安全系统也叫做安全链，它是独立于计算机系统的软硬件保护措施。采用反逻辑设计，将可能对风力机组造成严重损害的故障节点串联成一个回路，该回路主要包括:紧急停机按钮(塔底主控制柜)、发电机过速、扭缆开关、变桨系统安全链信号、紧急停机按钮(机舱控制柜)、振动开关、主轴过速模块、24 V电源失电、并网开关闭合信号、控制模块运行状况以及主线路闭合信号。一旦其中的一个节点动作，将引起整条回路断电，机组立刻即紧急停机，执行机构失电，机组瞬间脱网，并使主控系统和变桨系统处于闭锁状态，从而最大限度地保证机组的安全。如果故障节点得不到恢复，整个机组的正常的运行操作都不能实现。同时，安全链也是整个机组的最后一道保护，它处于机组的软件保护之后。

风力发电机组的安全链是十分重要的，在逻辑上，安全链系统的等级比控制系统要优先。其目的是为了确保风力发电设备在出现故障时，设备仍处于安全状态。如果出现比较大的故障，安全链系统的任务是保证设备安全动作，使24V和230V带电回路掉电，风机正常停机。安全链一般分为两部分:一级安全链和二级安全链，一级安全链主要是主控制系统的安全保护装置，二级安全链主要是变桨系统的安保装置。安全链的系统主要由复位按钮，并网接触器，主断路器，发电机超速模块，叶轮超速模块，振动开关，变桨柜急停按钮，主控制柜(塔底柜)急停开关，机舱急停开关等九个节点组成，串联到主控柜里中的安全继电器中，安全继电器是机组安全链的核心部件，是安全链的执行机构。机组上电后，正常状态下，整个安全链是带24V电的，如果机组某个部件出现故障时，那么与它所对应的节点断开，安全链失电。由安全继电器控制的230V供电回路同时失电，整个电磁阀回路和230V回路中的交流接触器失压，机组进行紧急刹车过程。执行机构的电源230VAC, 24VDC失电，机组处于闭锁状态。同时每一个结点的闭合和断开都有信号传到数字量输入模块中。在模块中，有信号指示灯来显示各个节点的状态。维护人员可通过各节点状态分析故障原因。